На мой взгляд, если на материнке нет четырех джамперов для установки частот FSB/PCI вручную, а предусмотрен только программный способ из BIOS (не предоставляется выбора "вручную/программно"), то, следовательно, какой бы режим работы ни был задан с помощью внешних элементов, он все равно будет изменен программно при инициализации системы.
На мой взгляд, если на материнке нет четырех джамперов для установки частот FSB/PCI вручную, а предусмотрен только программный способ из BIOS (не предоставляется выбора "вручную/программно"), то, следовательно, какой бы режим работы ни был задан с помощью внешних элементов, он все равно будет изменен программно при инициализации системы.