если например на одном выходе шимки под один транзистор - нормальный сигнал, а на другом - просто +Х вольт, безо всякого прямоугольного сигнала то это ж, насколько я понимаю, и на мультиметре видно должно быть - в виде разного напряжения подаваемого на базу.
Трансформатор ведь развязывает. Постоянка не пройдет. И получается, сквозной ток может быть только если один транзистор не закрылся, а второй уже открывается. Так что тут все в базах ключей или в самих ключах, диодах параллельных им, кондере на 1 мкф. Или, если блок хреновый, неудачно сделана защита от перегрузки, то в силовом трансформаторе и его нагрузке.