Теоретически можно, но трудно измерять столь малые

Теоретически можно, но трудно измерять столь малые напряжения в открытом состоянии,
тк в закрытом около 12V, не всякий осциллограф позволяет это сделать(некоторые специально
имеют такие функции, дифференциальный вход и большое допустимое синфазное напряжение).
Можно попробовать применить нелинейную цепь из резистора и диодного ограничителя,
чтобы уменьшить напряжение на входе осциллографа в закрытом состоянии транзистора
и почти не изменить в открытом.

Конденсаторы для замены я обычно снимаю с новых сдохших плат(проверяя конечно).
Покупаю только относительно высоковольтные(выше 16V, не для материнок). Но на ASUS
обычно всегда хорошие стоят, померьте ESR тех что Вы сняли и новых, может напрасно
меняли.

И еще верните старый CPU и проверьте нагрев преобразователя с ним.

P.S. Нечто подобное было в моей практике на моей плате ASUS P2L97-S старой ревизии,
ее CPU стаб перегревалася с Pentium2 Klamath. На новой ревизии 2.05 ASUS капитально
переделал CPU stab., и проблема исчезла.