У меня причиной сходных проблем с разными винтами

У меня причиной сходных проблем с разными винтами оказался... сата-привод. Раз в пару месяцев система периодически начинает виснуть на обращении к АТА устройствам, передергивание шлейфа сата привода - мгновенно исцеляет.
Потому - отключите от платы все лишнее, оставьте только проблемный винт, и проверьте работу. И попробуйте сменить сата-кабель.

Странные глюки Windows на WD5000AADS