Для вашей матплаты - без понятия.

Для вашей матплаты - без понятия. Если сильно хочется узнать - можете отследить кусок схемы. Причем это не обязательно окажется микросхема - нужная логика работы отлично реализуется на дискретных деталях.
Да и по вашим результатам измерений сигнал разрешения работы ШИМ имеется.

Базово - процессор. Опять же - по результатам ваших измерений вне зависимости от используемого режима заданный уровень напряжения можно было бы заметить на выходе преобразователя(ей) при нормальной работе.