Южник на данной материнке отвечает за USB порта.

Южник на данной материнке отвечает за USB порта. На материнка к примеру где стоит ХАБ (2 в одном) то собственно сам хаб отвечает. Но на данной материнке за USB именно южный мост управляет.
Я ещё в первом своём сообщении писал что нужно тщательно прозвонить все USB порты. Не только те что выходят сзади на материнке но и сами коннекторы для подключения на Front Panel.


Любая диагностика всегда начинается с внешнего осмотра, но а следующее это замер сопротивлений, напряжений.
Вообще если есть осциллограф то у южника есть кварц часовой (такая бочка обычно рядом) и посмотреть на нём импульсы.

Наверняка южник дохлый. Разве что ещё покопать и внимательно посмотреть может на USB КЗ по другой причине.
Но как вы писали изначально что батарейка садилась сама по себе, то 99% что южник мёртвый.

MSI G31M3-F ver.1.0 не стартует