Если бы длительность импульсов не резалась магампом,

Цитата:
Смотрю сигналы до дросселя МС и после. Никакой задержки нет. Форма идентична

Если бы длительность импульсов не резалась магампом, то на выходе +3,3в было бы +5в,

они же от одной обмотки транса запитаны каналы +3,3 и +5. Что-то вы не так или не там смотрите.
Осталось только магамп поменять.
Бывает ещё что резисторы делителя плывут.
Цитата:
но 12 и 5 поднимается, до 14-15В и 6-7В соответственно

Такого повышения быть не должно ! Видимо эти каналы без нагрузки оставляете ?
Странно , что защита OVP не срабатывает при таком повышении +12 и +5.
Порог срабатывания OVP +14,5 в и +6,1 в , по любому должна сработать.
Кстати чем и как нагружаете ?