Значит нужно пока оставить в покое EC и

Значит нужно пока оставить в покое EC и кнопку вкл. и смотреть на работу MAX1632, который формирует 5 и 3,3В.
Вообще, вы не кнопку ClearCMOS нажимаете наверно, а RESET:) Нажимаете кнопку SW1?
Смотрите на типовую схему из datacheet-а MAX1632, что его включает/выключает и смотрите на состояние этого вывода в каждом из случаев (когда нет няпряжений и когда есть).

Ремонт Ноутбука Acer Aspire 1353Xc