вообще то это самое первое действие. Проблем

1) Снимите таки радиатор, сотрите с него термопасту, и установите его на видяху так чтобы был зазор так же как вы описали - " ножки, в которые вкручиваются саморезы с обратной стороны, не достают до платы и не упираются в нее"
потом снимите, если будет отпечаток термопасты на радиаторе значит проблем с установкой кулера нет.

3) Все-таки думаю что запортачили видяшку, воздушкой качать на шарах безсвинцовку это извращение
Ну и на крайний вариант если не хочется верить в дефект чипа после прогрева то осмотрите плату на наличие потемнений, выгоревших деталей, или сколотых SMD компонентов