1) Снимите таки радиатор, сотрите с него термопасту,

1) Снимите таки радиатор, сотрите с него термопасту, и установите его на видяху так чтобы был зазор так же как вы описали - " ножки, в которые вкручиваются саморезы с обратной стороны, не достают до платы и не упираются в нее"
потом снимите, если будет отпечаток термопасты на радиаторе значит проблем с установкой кулера нет.
2) На какой температуре пропаивали Гпу, память? Как долго грели? С подогревателем или без? Сверху дули на чипы или с обратной стороны платы?

3) Все-таки думаю что запортачили видяшку, воздушкой качать на шарах безсвинцовку это извращение
Ну и на крайний вариант если не хочется верить в дефект чипа после прогрева то осмотрите плату на наличие потемнений, выгоревших деталей, или сколотых SMD компонентов