Транзистор, не знаю какой Вы проверяли, и TL431

Транзистор, не знаю какой Вы проверяли, и TL431 можно было не проверять. Следовательно, можно сделать вывод, что многое из необходимого проверить, Вы не проверили.
Выключающий блок аварийный сигнал высокого уровня в подобных схемах появляется на позитивном входе одного из четырёх элементов LM339, в частности на 5 выводе. Данный элемент самоблокируется за счёт положительной обратной связи (резистор и диод) с выхода (2 вывод) на вход (5вывод). Сделать сброс после этого можно только обесточив блок.
Что может вызвать появление аварийного сигнала?

1. Одно или несколько "ненормальных" напряжений из пяти (четырёх) выходных напряжений основного преобразователя.
Проверить все напряжения.
2. Неисправность схемы защиты.
Проверить все элементы схемы, т.е. от каждого выходного напряжения до подключенного к 5 выводу микросхемы диода.
Проверить элементы схемы срабатывания по перенапряжению.
Проверить конденсатор, осуществляющий задержку срабатывания защиты.