Какой смысл вести второй провод от разъема? -

Какой смысл вести второй провод от разъема? - это датчик напряжения (обратная связь) +3.3В. Схема осуществляет стабилизацию этого напряжения, с учётом падения в проводах, непосредственно на колодке ATX. Иначе при значительных токах для малого напряжения относительная ошибка будет большой.

Конденсаторы на входных ногах (1, 2 и 3) микросхемы нужны для выполнения интегрального закона регулирования. Иначе можем получить срабатывание защиты на каждый "чих". Ёмкость конденсаторов нужно подобрать так, чтобы они успели зарядится выше минимального значения срабатывания защиты по недонапряжению (UNDER VOLTAGE PROTECTION) за время работы внутреннего таймера при старте блока (110 мс).

P.S. после замены WT75200 на AT2005 уходит в защиту...