Asus m2n-sli deluxe

Ищите, кто у Вас закоротил. Средний вывод указанного элемента - выход 3в деж. питания (3VAUX).
Основные потребители и потенциальные клиенты - сеть и мост.
Снимите радиатор с моста и пальцами на указанные элементы.

Значит Super I/O не трогать.

Забыл. Еще варианты: TSB43AB23 и посторонние предметы (замятые контакты) в разъемах PCI и PCI-Ex.
TSB43 - очень ненадежный товарищ. Его нагрев обязательно проверить.

Все PCI PCI-Ex слоты давно проверены,мост контроллер холодные,при отключении от сети БЖ издает тихий свист.БЖ исправен.

Холодные они потому, что напряжение 3,3в засажено до 0 (предполагаю, Вы не сказали, сколько на среднем выводе указанного элемента).
Вариантов два:
1. снимать по одному с платы потребителей и контролировать КЗ.
2. Подключить к указанной Вами точке с КЗ источник тока с напряжением 1,5В-3,3в и ограничить ток 0,5А-1А. Ну и контролировать нагрев на плате.

По ходу мост SLI накрылся,но почему грелся только один мосфет.

Вроде писал уже - это 3в дежурное напряжение. По большому счету, питает цепи запуска платы. Греется только он потому, что основные источники питания на плате выключены.
Считаете, что мост виноват и плату надо в мусор - Ваше право. Вот только зачем тему создавали, не понял.