Под командной строкой имелась ввиду закрузка Command Promt

Под командной строкой имелась ввиду закрузка Command Promt Only i.e. "чистый ДОС".
В 98-ой rb000, rb001 - не папки а .cab архивы, лучше их скопировать, т.к. при восстановлении, вроде, с rb005 - будет ошибка, т.к. сначала архивируется текущий реестр и имя ему даётся именно rb005.cab
А восстанавливать: scanreg /restore