Вы для начала такую матплату найдите :).

Вы для начала такую матплату найдите. Интерфейс параллельный, но напряжение питания 2,7-3,6 В. Такие флешки в основном в ноутбуках встречались. Можно и на обычной матплате попробовать (из тех, что поддерживают параллельный интерфейс), но я бы предпочел программатор.
Из ПО - можно uniflash, если он поддерживает такие флешки, можно попробовать разные версии стандартных флешеров аля awdflash/amiflash.