Из инструкции следует, что джампер нужен

> Из инструкции следует, что джампер нужен для прошивки BIOS, да и размер bios.bin из временного файла от EVO равен 8 MB, что намекает на прошивку всего BIOS полностью.

Из инструкции вообще-то следует, что джампер нужен для прошивки региона ME, он и называется соответственно.
Вы почему-то воспринимаете прошивку как единое целое и что обязательно надо зашить те же 8Mb от А до Я.
Ну, т.е. один раз - да, надо было прошить полностью для обновления прошивки ME. Но больше обновлять ME не надо - берите с сайта апдейты и шейте только регион BIOS, джампер этому не мешает.