1. Хоть один реальный вариант железной проблемы можете

1. Хоть один реальный вариант железной проблемы можете написать? Если нет, забудем про ваше предположение.
2. Никто не извращается. Система установлена на SSD, HDD используется как второв в caddy. Неужели Вы предполагаете, что от места размещения операционной системы проявилась эта ошибка? Так что и эта мысль не принесла плодов.

3. Осмелюсь предположить, что если бы производитель не закладывал возможные изменения в отсеке для ODD, он бы не сделал крепление ODD только на одном винтике. Он бы не делал поддержки в BIOS (сообщается об успешном обнаружении и отображаются серийные номера, номера моделей и т.п.). Я бы на его месте приварил ODD к корпусу изнутри, как некоторые остальные несъемные компоненты в ноутбуках. Так что эта мысль тоже не годится.
4. Предполагаю в BIOS есть программная ошибка, которая не позволяет правильно управлять питанием при горячем рестарте (читай - перезагрузка). Либо это ограничение чипсета, в чём я очень сильно сомневаюсь. Либо действительно аппаратная недоработка схемы управления питанием компонентов ноутбука, при которой "правильная" перезагрузка невозможна, что тоже под сомнением. Скорее всего эту ситуацию не заметили при тестировании, т.к. ODD аварийно не паркует головки со щелчком а просто делает сброс (тихонько, как и полагается при перезагрузке).
5. Я проверил подключение HDD в caddy, привел все к стандарту SATA. 4-ый контакт не подключен к GND, резистор на 1-ом контакте заменил с 4,7 кОм на 1 кОм. Вроде бы правильно заработала загрузка после гибернации, но хорошо не проверял.

Благодарю за внимание, но... пользы мало.