На сторонней матери 12,2V; на портах PCI-контроллера,

Цитата:
А на работающих какая напруга?

На сторонней матери 12,2V; на портах PCI-контроллера, установленного в слоты матери с неработающим котнроллером - больше, чем ~11.6V.

Вообще - за прояснение схемотехники питания на выходе порта FireWire спасибо. Всегда неплохо заранее представлять - что там может встретиться.

PS.
А ты на какой матери смотрел?