По этой схеме - да. Сами подумайте - какая

По этой схеме - да.
Сами подумайте - какая разница откуда будут 12В. Они же там и там стабилизированные.
А вот ветка которая идет на резистор к 1-й ноге должна остаться от своих 12В.
Можете даже ту схему что сделана не трогать вообще, тогда никакие защиты точно не нарушатся. Просто подайте в эту точку через такой же диод свои 12В.
Но тогда останется открытым вопрос о том как выключить блок. Ну это не сложно совершенно. В схеме шидо практически есть готовая:).
Транзистор Q6. Подал на его базу внешние 12В через резистор - блок работает, пропали 12В блок остановился.

Модернизация компьютерного БП АТ