Single 3.3-volt operations − 3.3-volt Read −

"Single 3.3-volt operations − 3.3-volt Read − 3.3-volt Erase − 3.3-volt Program" - это из даташита на w39l040. А это из AT49F040 "Single Voltage Operation - 5V Read - 5V Reprogramming". Просто разные напряжения у них, вот и подумал , что в программаторе нужно будет подогнать напругу под 3.3 вольта на выходе.