Судя по описанию - может быть все, что

Судя по описанию - может быть все, что угодно. Что именно "дергается" и как - понять из описания сложно Было бы неплохо записать хотя бы видеоролик с десктопа...

Что могу посоветовать - в первую очередь, найти в инете (или собрать самому при помощи BartPE на другой машине) диск с Windows PE (aka LiveCD), с него загрузить ОСь и посмотреть, как она будет себя вести (т.о. исключаем вирусы/трояноподобные "приколы" и т.д.). Это насчет менюшек/прочих глюков гуя. Если глюки остались - большая вероятность помирающей клавы/контроллера клавы (отстегнуть клаву, подключить внешнюю и повторить эксперимент).

Насчет винта - попробовать ему сделать erase по всей поверхности с предварительным бэкапом/последующим востановлением инфы чем-либо (тот же Norton Ghost). Сначала очень рекомендую для проверки сделать erase мегабайт 10-20-50 в конце и просканить их mhdd - бывали у меня винты, которые при ирэйзе убивали поверхность. Если все ОК - смело erase. Поверхность должна улучшиться.

По поводу зарузки проца при перетягивании окон - с дровами на видео/мать все в порядке? Или же стандартные виндовые стоят? ИМХО - в эту сторону копать нужно...