Если отключить БИОС контроллера, то он не будет

Если отключить БИОС контроллера, то он не будет при старте опрашивать диски, но при этом останется возможность работать с ними поставив драйвера под WIN. Скорее всего в этом случае лучше диски использовать без функций зеркала и страйпа. Правда, по моему разумению, затеваете Вы все это зря. Чинить не сломанное - только портить. А возможность его отключения средствами БИОС, если мне не изменяет склероз, должна быть. Разницы в драйвере промиса с функциями рейда и без оного  настолько немного, что курочить ради этого БИОС (с потенциально летальным исходом) и без  серьезных причин можно только для того, чтобы опыта набраться. Но и в этом случае, я бы советовал выбрать какого-то другого подопытного кролика...