На 3055 это вы зря, рекомендую почитать про подбор аналогов wiki:Как_подобрать_аналог_полевого_транзистора?
А в общем варианта два, либо там в фазе сдохли оба ключа "верхний" и "нижний". Либо сдохла одна из фаз шима/драйвера ключей.
Кстати какой шим/драйвер там?
По поводу работы на двух фазах, многие шимки могут нормально работать в таком режиме. Но во первых надо проконтролировать осищилом нормально ли она работает, во вторых не стоит совать в такую мать сильно кушающие процы.
шим isl6566 .