Seega да, действительно можно напрямую отредактировать

Seega

да, действительно можно напрямую отредактировать содержимое CMOS. Я лично под Windows пользовался утилитой HWDirect. Под DOS даже не знаю, что может этим заниматься. Но в любом случае - для этого надо, чтобы хоть как-то грузилась операционная система. Про ее загружаемость Вы не сказали ни слова (см. выше мое возмущение касательно неполного описания ситуации)
+ Вполне вероятно, что после изменения настроек, БИОС будет тупить тем же образом, что и после сохранения через CMOS Setup. Но попробовать стОит.

напрямую в ЮМ. CMOS к флешке никакого отношения не имеет. Либо можно отредактировать специальным образом прошивку (потому что Вы сами начали говорить про то как изменить дефолтные настройки в прошивке), но как Вы будете ее прошивать не хочу даже гадать.