Как удобнее, но в пределах разумного. Лично я системный раздел больше 8Гб не делаю, хотя с другой стороны и миллениум-линолеум на домашние компы не ставлю: либо 95-98, либо уже сразу ХРюшку. В данном случае лучше будет что-нибудь типа С - 15-20Гб, D - все, что останется (или D и E - поровну). Это насчет размеров. Насчет чем разбивать - Acronis или Paragon Partition Manager, или, например PartitionMagic не ниже 7й версии: просто, наглядно и без потери данных.