1. Возможно все. Любую дочернюю платку можно

1.

Цитата:
ШИМ установлена на отдельной плате и подход к ней практически невозможен.

Возможно все. Любую дочернюю платку можно выпаять и проверить. Если это так сложно, почему бы не освободить место рядом с ней, выпаяв другие компоненты.

2. Вот вы описали поведение БП: при подаче питающего напряжения при непробитых транзисторах APFC лампа загорается и гаснет. При этом дежурка появляется. Значит APFC начнет работу только при запуске БП. А если покопаться в плате и схеме, выяснится, что запуск вашего APFC-PWM контроллера осуществляется подачей на него напряжения питания.
3. Какое производителю захочется напряжение выставить на входном конденсаторе фильтра, такое он и выставит. Это всего лишь вопрос номиналов нескольких резисторов делителя обратной связи.

CORSAIR TX650W - APFC.