Ничего не указано о сбросе настроек, хранящихся

Ничего не указано о сбросе настроек, хранящихся в CMOS RAM. Не указана версия BIOS, которая была прошита. Не указано состояние элементов в окрестностях микросхемы, хранящей BIOS, с учетом ее отпаивания/припаивания.
Вместо бездумной замены компонентов было бы неплохо проводить диагностику. В примитиве можно замкнуть PS_ON# (на разъеме для подключения БП) на GND после включения и спокойно работать с интересующими сигналами.