Такое поведение кулера чаще связано с его неисправностью,

Такое поведение кулера чаще связано с его неисправностью, а именно с отсутствием сигнала FANSIG. Проверяется это очень легко. Когда кулер начитает глючить, убедиться в наличии стабильного напряжения на 1 выводе кулера, наличия непрерывного сигнала управления CPUFAN# и конечно сигнала с кулера FANSIG. Сигнал FANSIG лучше смотреть осциллографом. Выводы делать на основе измерений.