Если есть вторая рабочая карта, тогда всё проще. Сравнивайте

Если есть вторая рабочая карта, тогда всё проще.
Сравнивайте обвязку у ШИМ-ов.
Где-то косяк сидит.
Или к.з., или обрыв, или м\с сидит криво.
Работа нудная, но другого предложить нечего.
Вот ещё проведите замеры из этой темы:
rom.by/forum/Pomogite_s_VTX_AMD_Radeon_R9_290_AXR9_290_4gbd5-mdhx?page=2


VCC, EN, VRHOT_ICRIT#.
Если обвязка и нагрузка целая, ШИМ запустится.
И удалите флюс после пайки, соблюдайте чистоту.