Как мне это видится наиболее безопасно: 1. скопировать содержимое

Как мне это видится наиболее безопасно:
1. скопировать содержимое флеш с биосом (в идеале - обоих флешек) с помощью программатора. С обязательной верификацией.

В свете того, что на оф. сайте лежит только обновление самого биоса, не полные образа флешек и взять будет негде, если что-то не заладится и плата превратится в кирпич, такая предосторожность - не лишняя.
2а) взять любое понравившееся обновление и прошить штатными средствами. Флешер сам разберется, что и куда шить. Естественно, шить лучше под DOS.
2б) на основании снятого бэкапа и обновления пересобирать образ и прошить его программатором.