Вы напрасно начали с замены конденсаторов, не проведя

Вы напрасно начали с замены конденсаторов, не проведя никаких измерений. Заменить можно было бы один конденсатор 100мкФ по второму выходному напряжению дежурки.
В первую очередь надо было выяснить причину срабатывания защиты, т.е. что вызывает появление аварийного сигнала на 5 выводе LM339.