между нераспаянным AGP и PCI есть два транзистора D1703, один из которых греется так, что невозможно дотронуться
то можно опытным путем подобрать пару транзисторов с максимально похожей характеристикой Rds(on)=f(Vgs). Хотя тот транзистор, который не греется, может быть элементарно дохлым, например.
Если проблема описана верно: