Инженерная это может быть несколько громко

Инженерная — это может быть несколько громко сказано, потому что и в AFUDOS для ASUSTeK, и в AFUDOS для всех других пользователей есть ключи командной строки, которые позволяют задать нужный режим программирования.

Другое дело, что версия AFUDOS для ASUSTeK не документирует эти ключи. Но в общедоступной версии AFUDOS это известно:

The optional field used to supply more information for flashing BIOS ROM.
Following lists the supported optional parameters and format:
• /P Program main bios image
• /B Program Boot Block
• /N Program NVRAM
• /C Destroy CMOS after update BIOS done
• /E Program Embedded Controller block if present
• /K Program all non-critical blocks
• /Kn Program n’th non-critical block only (n=0 – 7)
• /Q Quiet mode enable
• /REBOOT Reboot after update BIOS done
• /X Do not check ROM ID
• /S Display current system’s BIOS ROM ID
• и так далее...