Перефразируя классика - любой BIOS можно модифицировать. А

Перефразируя классика - любой BIOS можно модифицировать. А тот, который нельзя модифицировать, - просто на него нужно потратить немного больше времени. Коллега Santa правильно обрисовал суть проблемы.
Можно добавить только, что всегда следует детализировать предметную область. В Вашем случае это, скорее всего, ROMPaq. И неудача с его модификацией - всего лишь результат отсутствия опыта работы с ним. Если используется Phoenix BIOS, то это облегчает задачу: в интернете немало примеров доработки для использования той или иной mini-PCI платы.