Запустить из BootBlock DOS+Uniflash будет сложно, DOS на полную использует BIOSные прерывания.. Те же видеокарта, флоппи - не включены и не настроены.
Тем не менее оно работает таким образом перешивал одну хитрую Jetway
А вот про настройку выдачи отладочной информации через COM-Port и модификации для этого бут-блока ....можно подробности?