С какой целью прошивают BIOS?

Исключительно с целью добычи "философского камня". Хотя попадаются некоторые индивидуумы, которые думают, что могут получить от этого практическую пользу.
Хочу отметить, что на форуме обсуждаются все-таки конкретные вопросы. Без конкретного вопроса/модели матплаты тема отлично смотрелась бы во Флейме.

Совсем не обязательно. Бывает что в новых пршивках вносят "революционные изменения" типа поддержки новых видов процессоров или добавление новых функций.
Но по сути maco прав - изменения (для новых версий) носят характер отлавливания багов, которых простой пользователь никогда бы и не заметил. Ну и мифическое обновление микрокодов CPU забывать не нужно..