Тут ничего не скажу. Я очень редко

Цитата:
безопасно ли с прошивкой от Z97 ставить поверх прошивки от H97 или накатывать от Z97

Тут ничего не скажу. Я очень редко обновляю прошивки штатными средствами.
И никогда не обновляю из-под WIN. Насколько надежны такие прошивальщики? Клиенты после такой перепрошивки приходят с завидной регулярностью.

Если при обновлении штатными средствами будет обновляться только сам биос - ничего страшного не должно произойти.